Celní správa v Česku: co dělá a čím se liší od finanční správy

Většina obyvatel se s Celní správou potká jedním ze dvou způsobů: na letišti v Ruzyni s taškou zboží, u něhož si nebyli jistí, nebo na silnici, když zastaví kamion. Mezi tím stojí instituce se širokými a občas překvapivými úkoly, od výběru daně z benzinu ve vaší nádrži po kontrolu, zda zboží na tržním stánku není padělek. Pro firmy je to druhý daňový orgán v zemi a je dobré vědět, s kterým z nich právě jednáte.

Tento výklad popisuje roli Celní správy obecně. Není to právní ani daňové poradenství. U konkrétního případu si ověřte stránky Celní správy a zvažte celního poradce.

Kde Celní správa stojí

Celní správa České republiky je správní úřad státu podřízený Ministerstvu financí. Má hierarchii: nahoře Generální ředitelství cel v Praze, pod ním celní ředitelství a celní úřady, které jednají s veřejností a s firmami. Její příslušníci nosí uniformu a mají pravomoci stanovené zákonem, včetně kontroly a ve vymezených případech zadržení. K jejímu místu mezi ministerstvy a úřady viz jak je zorganizován český stát.

Celní právo má dvě vrstvy. Na úrovni EU stanoví pravidla celní unie celní kodex Unie a prováděcí akty. Vnitrostátní zákony, například celní zákon, je doplňují a upravují národní pravomoci a postupy.

Clo na hranici EU

Česko nemá moře, vnější hranice EU se tu proto nacházejí hlavně na letištích, v poštovním provozu a na vnitrozemských celních úřadech, kde se zboží proclívá. Celní správa zpracovává dovozní a vývozní celní prohlášení, uplatňuje celní sazby a kontroluje zboží z hlediska původu, hodnoty a zařazení. Firma, která chce číslo EORI, celoevropský identifikátor pro celní řízení, o něj žádá u celního orgánu. Stranu vývozce popisuje průvodce základy vývozu.

Při dovozu jsou pro firmy klíčové zařazení zboží, celní hodnota, uplatnění preferencí nebo původu a úhrada cla a dovozního DPH. Dovozci mohou před zahájením obchodu získat závazné informace o sazebním zařazení, které na určitou dobu zajišťují právní jistotu. Celní správa také uděluje zjednodušené postupy a povolení, například status schváleného hospodářského subjektu (AEO) pro spolehlivé obchodníky, a to za podmínek stanovených právem EU.

Do její působnosti spadají i cestující. Pro cestující přijíždějící ze zemí mimo EU platí limity pro zboží a pravidla pro produkty živočišného a rostlinného původu. Hotovost ve výši 10 000 EUR a více, která vstupuje do EU nebo z ní vystupuje, se musí podle pravidel EU deklarovat (stav k roku 2026; ověřte u Celní správy). Pro tabák a alkohol platí osobní limity.

Spotřební daně

Za hranicí spravuje Celní správa spotřební daně, skupinu zvláštních daní na vybrané zboží: minerální oleje a pohonné hmoty, lihoviny a další alkoholické nápoje, pivo a tabákové výrobky. Výrobci, dovozci a provozovatelé daňových skladů s tímto zbožím nakládají na základě povolení a pod dohledem. Daň obecně vzniká při uvolnění zboží do spotřeby a pro skladování a přepravu s odloženou daní platí zvláštní režimy. Sazby a podmínky stanoví zákon a čas od času se mění (stav k roku 2026; ověřte u Celní správy).

Celní správa spravuje také další energetické daně, a to z elektřiny, plynu a pevných paliv. Firma, která s těmito produkty obchoduje, musí počítat s registrací a kontrolami, odděleně od jednání s úřadem pro DPH. K fungování DPH viz DPH v Česku.

Vymáhání a zakázané zboží

Velkou část práce tvoří vymáhání pravidel. Celníci kontrolují zakázané nebo omezené zboží: padělky, ohrožené druhy podle úmluvy CITES, zbraně, prekurzory drog, nebezpečné zboží, nepovolené léky a zboží zasílané v rozporu se sankcemi. Zasahují také proti pašování tabáku a alkoholu a proti podvodům se spotřebními daněmi a sdílejí informace s dalšími národními orgány a institucemi EU.

Držitelé práv mohou celní správu požádat o zásah proti padělkům prostřednictvím žádosti o zásah. K registraci ochranných známek viz české ochranné známky a duševní vlastnictví.

Celní správa má v některých oblastech, zejména u celních a spotřebních deliktů, pravomoci k trestnímu vyšetřování. Kontroluje také firmy, zvlášť v obchodu s pohonnými hmotami a při pohybu zboží podléhajícího spotřební dani.

Mýtné a další povinnosti

Celní správa má také roli při vymáhání mýtného za těžká vozidla v rámci národního mýtného systému a na silnicích kontroluje jeho dodržování. Provozovatel mýta a pravidla jsou samostatná témata, takže pokud provozujete nákladní vozy, ověřte si oficiální zdroje.

Její úkoly se v čase měnily legislativními novelami, takže jejich seznam není pevný. Aktuální působnost najdete na webu Celní správy.

Celní správa a finanční úřad

Celní správa a Finanční správa se často pletou. Finanční správa se svými finančními úřady vybírá mimo jiné daň z příjmů, DPH z tuzemských transakcí a majetkové daně. Celní správa vybírá dovozní cla, dovozní DPH v souvislosti s celním řízením a spotřební daně. Firma může jednat s oběma: přiznání k DPH podává finančnímu úřadu, podání ke spotřebním daním celnímu úřadu. K finančnímu úřadu viz jak podat přiznání k DPH v Česku.

Oba orgány si vyměňují informace a nesoulad mezi celními údaji a přiznáními k DPH patří k tomu, co kontroloři hledají.

Jednání s úřadem

Firmy, které dováží nebo vyvážejí, často využívají celní zástupce, kteří za ně podávají prohlášení a odpovídají za odborný postup. Proti celním rozhodnutím se lze odvolat v řízení stanoveném celním právem EU a vnitrostátními pravidly, s přísnými lhůtami. Žádost o závazné sazební zařazení nebo rozhodnutí o původu se podává písemně přes systém.

Před příštím dovozem se zeptejte zástupce na kód zboží, sazbu cla a požadované doklady a vše si zapište. Zabere to deset minut a ušetří překvapení na hranici.

Toto je obecný výklad, nikoli právní ani daňové poradenství.